Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3961234	3961648	415	15 [0]	[0] 12	yhjH	EAL domain containing protein involved in flagellar function

GCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTT  >  W3110S.gb/3961649‑3961709 |                                                             gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAAtt                           >  1:464278/1‑36 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGcc                      >  1:423312/1‑41 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:1139846/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:1197925/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:1254554/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:1407268/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:1446694/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:271021/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:291514/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:604769/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:743406/1‑61 (MQ=255) gCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGAtttt  >  1:774445/1‑61 (MQ=255) |                                                             GCCGAAAGATTCAACCTTTGCCTCGATGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTT  >  W3110S.gb/3961649‑3961709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑