Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3972761	3972971	211	27 [0]	[0] 55	[gadA]	[gadA]

ATCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGA  >  W3110S.gb/3972972‑3973011 |                                        aTCAATGTTGAATTATATCTTGATGGCAACCCTCGTCa    >  1:689814/1‑38 (MQ=14) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAg   >  1:9722/1‑39 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAg   >  1:1183470/1‑39 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAg   >  1:1253618/1‑39 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:825990/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:523516/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:556111/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:559582/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:571724/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:572583/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:600607/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:608334/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:660932/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:665763/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:732730/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:804771/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:806981/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:819127/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:475319/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:826187/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:839948/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:844296/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:854219/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:901781/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:919440/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:926724/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:929014/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:949609/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:975100/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1901/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1157211/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1158845/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1218913/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1270464/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1373033/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1376326/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1443504/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1448031/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1449824/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1450081/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:163397/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:189664/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:490981/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:196091/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:243425/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:293870/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:307625/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:329175/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:367714/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:370344/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:378197/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:384933/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:390179/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:45952/1‑40 (MQ=40) aTCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGa  >  1:1074911/1‑40 (MQ=40) |                                        ATCAATGATGAATTATATCTTGATGGCAACGCTCGTCAGA  >  W3110S.gb/3972972‑3973011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑