Missing coverage evidence...
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TTGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGC  >  W3110S.gb/3980083‑3980143 |                                                             ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:649777/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:44876/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:449475/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:46147/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:496201/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:503750/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:530737/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:554662/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:606290/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:61456/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:617525/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:392284/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:656236/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:712920/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:783042/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:799934/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:802984/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:814581/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:834374/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:893345/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:938624/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:946567/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1400122/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1145869/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1194052/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1216619/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1247585/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1288660/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1307297/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1322014/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1380161/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1129323/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:161259/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:181518/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:195643/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:203065/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:206494/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:253103/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:276353/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:312174/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:319373/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:356554/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCATGCAAGc  <  1:1186479/61‑1 (MQ=255) ttGATACCCGGACGAATGAGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGc  <  1:1361210/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTGATACCCGGACGAATGCGTTGCAAACCGGAAACGATCACCCGATCGCCAGCCTGCAAGC  >  W3110S.gb/3980083‑3980143

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑