Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3982558	3982770	213	19 [0]	[0] 51	gadE/hdeD	DNA‑binding transcriptional activator/acid‑resistance membrane protein

CAACACTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCGG  >  W3110S.gb/3982771‑3982833 |                                                               caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGt               >  1:521367/1‑50 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATcc    >  1:271724/1‑61 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATcc    >  1:1388935/1‑61 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:758183/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:464408/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:476737/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:528683/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:529358/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:533191/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:556192/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:576455/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:675073/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:689463/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:725833/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:746330/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:902431/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:761561/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:765949/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:780047/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:792313/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:793494/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:836430/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:852377/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:879775/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:881022/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:89830/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1025338/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:140009/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1041452/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:104932/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1051169/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1077589/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1110564/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:112540/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:119104/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1244706/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1279672/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1296744/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:339614/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:1417921/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:153524/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:165027/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:179839/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:182637/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:200333/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:221699/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:253783/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:265137/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:266707/1‑62 (MQ=255) caacaCTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCg   >  1:271/1‑62 (MQ=255) caacaCTGC‑TAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCgg  >  1:1128871/1‑62 (MQ=255) |                                                               CAACACTGCGTAGCGGAGAGAGTATTAATCGGATCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCGG  >  W3110S.gb/3982771‑3982833

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑