Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3986764	3986810	47	21 [0]	[0] 39	slp/insH	outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator

TTAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGAA  >  W3110S.gb/3986811‑3986871 |                                                             ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:674171/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:308065/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:365475/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:416307/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:465762/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:485198/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:575514/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:599384/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:638356/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:671945/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:270577/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:685630/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:759410/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:808136/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:812231/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:851569/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:897372/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:927497/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:969508/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:265593/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1031028/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1102264/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1138604/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1156138/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1160549/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1190925/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1207810/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1220467/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:125679/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1296840/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1316162/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1465083/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:178391/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:18961/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:230492/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:1018251/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGCATTGAAATACTTCGaa  >  1:1273341/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTCGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGaa  >  1:474592/1‑61 (MQ=255) ttAAATAAGGCGTGTGTGACAGTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATAc        >  1:1281917/1‑55 (MQ=255) |                                                             TTAAATAAGGCGTGTGTGACATTTTTTTTGGGTTAAGCGTCTCGTATTGAAATACTTCGAA  >  W3110S.gb/3986811‑3986871

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑