Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4001865	4002720	856	83 [0]	[0] 25	pitA	phosphate transporter, low‑affinity

CAAGCAATAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGCAAACA  >  W3110S.gb/4002721‑4002765 |                                             caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:300581/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:907938/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:807747/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:770767/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:770045/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:73832/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:68897/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:623765/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:621214/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:60306/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:57440/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:544291/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:523226/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:1015871/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:279004/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:270449/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:259227/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:250426/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:23769/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:201941/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:1345802/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:1306076/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:1279740/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:112267/45‑1 (MQ=255) caagcaaTAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGcaaaca  <  1:1072224/45‑1 (MQ=255) |                                             CAAGCAATAATAACAGCCCGGTATGCAAATCCAGGCCAGCAAACA  >  W3110S.gb/4002721‑4002765

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑