Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4021215	4021595	381	16 [0]	[0] 34	[rhsB]–[nikR]	[rhsB],[nikR]

GTGATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTC  >  W3110S.gb/4021596‑4021649 |                                                      gtgATGATTCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:872873/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCTGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1015588/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:427181/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:967127/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:451800/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:490516/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:49403/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:532337/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:609512/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:654075/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:659542/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:691232/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:702534/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:767005/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:794771/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:816257/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:860031/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:365371/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1022917/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1049354/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1065363/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1097152/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1168233/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1250415/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1259982/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1396742/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:186831/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:187856/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:24667/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:273895/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:30448/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:363825/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:414892/54‑1 (MQ=255) gtgATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGACGCGTTTTTCGTGTTc  <  1:1012083/54‑1 (MQ=255) |                                                      GTGATGATGCTGGGTGGAGACAATGCGGCTGGCTAAGTCGCGTTTTTCGTGTTC  >  W3110S.gb/4021596‑4021649

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑