Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4047320	4047420	101	8 [0]	[0] 37	livF	leucine/isoleucine/valine transporter subunit

ATTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCT  >  W3110S.gb/4047421‑4047482 |                                                              aTTTGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:439771/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTc   >  1:476611/1‑61 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:543481/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:281288/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:282928/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:301028/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:358981/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:381930/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:397032/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:5206/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:279425/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:544251/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:635507/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:661751/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:664685/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:808609/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:85892/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:870283/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:879606/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1240847/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1063932/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1076072/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:107679/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1095429/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1096280/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1159564/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1220069/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1237475/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1028233/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:129452/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1380187/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1414236/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1423836/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1461766/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:161345/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:183461/1‑62 (MQ=255) aTTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCATTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCt  >  1:1241257/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATTGGTCGTGCGCTGATGAGCAACCCGCGTTTGCTACTGCTTGATGAGCCATCGCTCGGTCT  >  W3110S.gb/4047421‑4047482

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑