Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4083520	4083595	76	12 [0]	[0] 44	[rtcB]–[rtcA]	[rtcB],[rtcA]

GCACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCGG  >  W3110S.gb/4083596‑4083657 |                                                              gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCTGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:8296/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGTGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:365705/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:643878/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:213593/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:222866/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:263505/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:296480/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:31635/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:33615/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:42373/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:462244/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:475773/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:191164/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:741143/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:742909/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:75451/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:767830/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:806535/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:80957/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:882888/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:910570/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:992762/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1238046/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1009614/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:105078/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1055737/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1063779/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:108413/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1087836/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1099/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1167594/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1176950/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1212170/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1003241/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1242747/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1283246/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1319984/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1333360/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1336929/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1379241/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1393268/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1427850/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1461581/62‑1 (MQ=255) gcACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCgg  <  1:1464814/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCACAGGGCGAAGGTGGCGGGCAGATCCTGCGCTCGGCGCTGAGCCTGTCGATGATAACCGG  >  W3110S.gb/4083596‑4083657

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑