Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4117997	4118092	96	16 [0]	[0] 35	yrfD	predicted pilus assembly protein

CTGCTTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGCC  >  W3110S.gb/4118093‑4118149 |                                                         ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:674579/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:268658/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:273761/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:339752/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:348507/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:35280/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:417352/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:582686/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:665784/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:237392/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:707908/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:760212/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:779095/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:826169/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:838351/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:950443/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:979437/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:98835/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1204104/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1016264/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1020198/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1036571/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1118161/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1145595/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:117970/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1197167/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1202497/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1004209/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1229210/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1235703/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1254809/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1290099/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:1366061/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:167423/57‑1 (MQ=255) ctgctTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGcc  <  1:237078/57‑1 (MQ=255) |                                                         CTGCTTACTCTGGCAGAAAGGTTGCGTGTTCATGTGAGCGCGATCACCCCGGATGCC  >  W3110S.gb/4118093‑4118149

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑