Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4147844	4147915	72	82 [0]	[0] 23	[tsgA]	[tsgA]

ATTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGA  >  W3110S.gb/4147916‑4147977 |                                                              aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1459261/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:850711/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:729339/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:725821/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:620616/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:610890/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:565092/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:551548/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:508378/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:451134/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:300892/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:269588/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1020404/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1379810/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1379017/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1349615/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1332353/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1280331/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1240193/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1191904/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1131810/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:1102570/62‑1 (MQ=255) aTTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGa  <  1:106843/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATTTTGTGATCTGTTTAAATGTTTTATTGCAATCGGTTGCTAAATTGCATTTTAAGAGGTGA  >  W3110S.gb/4147916‑4147977

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑