Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4175584	4175657	74	45 [0]	[0] 48	gspL	general secretory pathway component, cryptic

TGTTGTTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCC  >  W3110S.gb/4175658‑4175719 |                                                              tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGAt              >  1:803335/1‑50 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTgac  >  1:1107871/1‑60 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTg    >  1:105637/1‑60 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:746915/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:373844/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:379013/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:380107/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:39857/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:509588/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:525269/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:627131/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:64035/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:661668/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:694812/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:72010/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:736044/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:323718/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:764374/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:813203/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:81370/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:862402/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:888280/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:936589/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:972312/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:999121/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1269578/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1046033/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1096903/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1119802/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1130038/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1131636/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:118924/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1225506/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1241457/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1259256/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1003575/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1282010/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1310907/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1335688/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:1377946/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:148424/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:168188/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:18638/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:204126/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:258877/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGcc  >  1:295533/1‑62 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGc   >  1:833237/1‑61 (MQ=255) tgttgtTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGATCCGGCTGc   >  1:106030/1‑61 (MQ=255) |                                                              TGTTGTTGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCC  >  W3110S.gb/4175658‑4175719

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑