Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4190869 4190888 20 35 [0] [2] 74 rpsC 30S ribosomal subunit protein S3

TGGTTGCTGACAGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAC  >  W3110S.gb/4190878‑4190949
           |                                                            
tGGTTGCTGACAGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAg            <  1:1064209/62‑1 (MQ=255)
tGGTTGCTGACAGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAg            <  1:152107/62‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTTCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:618934/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:44469/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:572267/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:514138/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:513796/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:508576/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:490701/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:487426/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:452626/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:289786/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:414064/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:406455/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:38301/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:362039/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:348118/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:321948/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:293454/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:23920/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:838884/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:98886/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:981706/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:973312/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:916881/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:897153/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:865803/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:849817/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:843335/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:580032/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:823278/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:791774/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:756501/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:721312/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:702279/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:691060/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:647912/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1178968/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1285686/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1282405/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1259609/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1248473/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1246278/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1214163/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1205070/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1182009/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1309332/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1122210/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:111683/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1110189/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:110482/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1084909/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1077131/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1030259/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1026116/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1424713/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:229473/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:211957/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:205593/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:200714/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:198733/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:190523/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:16953/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:163961/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:157407/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1018993/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1420492/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1403950/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1400412/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1366024/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:1365661/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:134107/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTAAGAAGCGTGCTGTAc  <  1:581515/61‑1 (MQ=255)
           aGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGGTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAc  <  1:576993/61‑1 (MQ=255)
           |                                                            
TGGTTGCTGACAGCATCACTTCTCAGCTGGAACGTCGCGTTATGTTCCGTCGTGCTATGAAGCGTGCTGTAC  >  W3110S.gb/4190878‑4190949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: