Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4208070	4208250	181	16 [0]	[0] 39	smg	conserved hypothetical protein

CTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCGCGC  >  W3110S.gb/4208251‑4208290 |                                        cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATATAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1011426/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:390071/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:9968/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:418643/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:483223/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:625877/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:651927/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:664385/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:674010/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:676205/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:689978/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:741162/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:791313/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:806401/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:83455/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:867358/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:874956/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:908200/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:964348/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1003980/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1283091/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1060784/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1098459/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:110622/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1124362/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1131850/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1163501/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1208036/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1276220/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1277514/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:357911/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1298298/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:133561/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1396868/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:1426752/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:237243/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:24952/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:310763/40‑1 (MQ=255) cTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCgcgc  <  1:350458/40‑1 (MQ=255) |                                        CTTGAAACTCGTGAAATGGTGATAGAGCGAGTGCTCGCGC  >  W3110S.gb/4208251‑4208290

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑