Missing coverage evidence...
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CATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCG  >  W3110S.gb/4239368‑4239410 |                                           cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:215272/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:985556/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:661832/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:661635/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:632712/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:625687/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:625656/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:569862/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:494879/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:36468/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:331251/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:326942/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:310534/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:272003/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1017447/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1466390/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1426536/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1352417/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1264189/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1235324/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1228100/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:121526/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1202790/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1184609/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1164175/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1078922/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1057184/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCg  <  1:1035292/43‑1 (MQ=255) cattcCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAAATCCCCGCGCCg  <  1:539164/43‑1 (MQ=255) |                                           CATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCG  >  W3110S.gb/4239368‑4239410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑