Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4304279	4304298	20	20 [0]	[0] 36	yjcP	predicted outer membrane factor of efflux pump

CGCATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTGG  >  W3110S.gb/4304299‑4304360 |                                                              cgcATCCAGCTGCGTGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1246032/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:7456/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:360395/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:394249/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:511956/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:538444/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:608958/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:613170/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:655072/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:706812/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:730395/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:295912/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:76732/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:811453/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:824287/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:844397/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:927025/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:940952/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:990296/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1321368/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1092265/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1130489/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1170288/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1272423/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1283794/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1288478/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1295894/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1315849/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1040779/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1398035/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:141514/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:1430279/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:152893/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:186857/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:271002/62‑1 (MQ=255) cgcATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTgg  <  1:29546/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCATCCAGCTGCGGGTCATTGAGTTGTTTCCACCACTGCGCCTGCGGCCAGCCGGAGCTGG  >  W3110S.gb/4304299‑4304360

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑