Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4309546	4310113	568	17 [0]	[0] 47	[yjcS]	[yjcS]

TAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTG  >  W3110S.gb/4310114‑4310167 |                                                      tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:717787/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:479882/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:560887/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:56563/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:569264/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:570089/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:570898/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:577346/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:611341/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:65240/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:695362/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:701133/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:402409/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:735617/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:755548/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:760601/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:787601/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:789807/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:879160/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:903619/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:907160/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:936541/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:956475/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:998957/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1394857/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1042624/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1085518/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1106934/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1136249/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:115564/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1159720/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1172817/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1188132/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1196564/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1277652/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1327052/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:102401/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1439848/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1455339/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:1466542/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:17043/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:239348/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:278852/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:353186/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:388363/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:389238/54‑1 (MQ=255) tAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTg  <  1:395915/54‑1 (MQ=255) |                                                      TAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTG  >  W3110S.gb/4310114‑4310167

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑