Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4334292	4334315	24	18 [0]	[0] 39	yjcZ	conserved hypothetical protein

CAGCATCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTCCC  >  W3110S.gb/4334316‑4334377 |                                                              cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:676330/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:290522/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:346717/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:373478/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:39926/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:428489/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:430213/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:486040/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:490617/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:618672/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:192963/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:701652/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:70897/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:758287/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:821144/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:837053/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:879348/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:89422/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:898295/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:922703/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1256531/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1146920/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1163874/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1170973/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1171087/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:118372/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1197938/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1198784/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1213427/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1230503/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1022846/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:129108/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1323408/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1324110/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1433450/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1442663/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1456459/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:1462021/62‑1 (MQ=255) cagcaTCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTccc  <  1:171258/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGCATCTGGCGCTGCTGCAAAAAATGGATCACCGCCAGCACTCTGCTTTCCCGGAGCTCCC  >  W3110S.gb/4334316‑4334377

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑