Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4435219	4435346	128	6 [0]	[0] 41	cycA	D‑alanine/D‑serine/glycine transporter

ATGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCGT  >  W3110S.gb/4435347‑4435408 |                                                              aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGttt                >  1:306442/1‑48 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGATCTGTTCgt  >  1:343316/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:618583/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:42830/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:466070/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:468506/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:540324/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:547609/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:589693/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:616993/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:617375/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:993658/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:620936/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:661676/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:677590/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:818171/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:834168/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:842845/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:945052/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:946700/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:964847/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1044597/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1347654/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1066511/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1092961/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1155688/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1165125/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1268782/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1281877/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:395425/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1368692/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1389053/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1391736/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:1405709/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:155627/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCgt  >  1:338570/1‑62 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCg   >  1:1262635/1‑61 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCg   >  1:1260217/1‑61 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCg   >  1:1195107/1‑61 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCg   >  1:22900/1‑61 (MQ=255) aTGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTAGAACTGTTCgt  >  1:185600/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCGT  >  W3110S.gb/4435347‑4435408

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑