Missing coverage evidence...
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CGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGT  >  W3110S.gb/4439399‑4439460 |                                                              cGGCTTTATCTGAGGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:395780/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATc                           >  1:1078848/1‑37 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTa       >  1:765869/1‑57 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCgg   >  1:482354/1‑61 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCgg   >  1:854784/1‑61 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:79005/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:446507/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:460028/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:506639/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:550083/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:628391/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:643661/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:761014/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:995697/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:883709/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:886185/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:897264/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:953436/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:962892/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:984499/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1015795/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1427250/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1041304/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1086241/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1088046/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1117855/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1118259/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1295483/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1350348/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1375607/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:433762/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:1434942/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:15051/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:168485/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:247648/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:271470/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:281927/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:326111/1‑62 (MQ=255) cGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGt  >  1:334429/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGCTTTATCTGACGGAGAGGTTTCGAAACGGATATCCAGTTTCTTATCGCCAGCTATCGGT  >  W3110S.gb/4439399‑4439460

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑