Missing coverage evidence...
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CGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTA  >  W3110S.gb/4456164‑4456205 |                                          cGCTCAACCGCTTTTCTGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1224829/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCGGCAAATCGTCGCTa  >  1:480358/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:727256/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:519630/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:532360/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:550284/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:567726/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:592380/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:665364/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:66629/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:670594/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:687407/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:704203/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:989746/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:776337/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:842264/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:901279/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:915131/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:935088/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:945449/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:952491/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:975497/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1011537/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:21386/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1026952/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:109647/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1127033/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1163730/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1185688/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1343620/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:1461538/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:152937/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:174772/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:512353/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:241204/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:254633/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:27605/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:276334/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:324975/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:379877/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:384965/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:393836/1‑42 (MQ=255) cGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTa  >  1:471251/1‑42 (MQ=255) |                                          CGCTCAACCGCTTTTCAGTCGCGATGCAGCAAATCGTCGCTA  >  W3110S.gb/4456164‑4456205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑