Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4489012	4489012	1	13 [0]	[0] 41	holC/pepA	DNA polymerase III, chi subunit/aminopeptidase A, a cyteinylglycinase

GCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGG  >  W3110S.gb/4489013‑4489073 |                                                             gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1175259/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:911731/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:899569/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:86988/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:770079/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:617287/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:528447/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:489113/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:488132/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:447941/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:444556/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:366001/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:332976/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:30567/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:298194/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1358110/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1197478/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1205824/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1216893/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1342647/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1050767/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1386013/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1418821/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1443367/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:189845/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:200565/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:203769/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:64502/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:893417/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:876912/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:875355/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:1183071/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:953741/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:841264/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:768954/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:749627/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:216403/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCgg  >  1:458311/1‑61 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACCAGTTCAGTGCtgtg          >  1:260338/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCATACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:735261/1‑53 (MQ=255) gcgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGACTACGAGTTCAGTGCtgtg          >  1:1177761/1‑53 (MQ=255) |                                                             GCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGG  >  W3110S.gb/4489013‑4489073

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑