Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4501339	4501361	23	66 [0]	[0] 66	leuX/intB	tRNA‑Leu/predicted integrase

ATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGATG  >  W3110S.gb/4501362‑4501423 |                                                              aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTTAtg  <  1:186366/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:574436/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:65525/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:644837/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:607444/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:600452/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:594281/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:59335/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:576129/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:681027/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:554874/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:463561/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:429243/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:417001/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:415906/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:372498/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:344565/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:810785/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:982932/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:980690/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:910980/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:871707/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:853978/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:833876/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:81355/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:813478/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:340835/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:809201/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:805704/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:79176/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:769420/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:727593/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:72503/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:696435/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1321562/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1055023/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1067774/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1068259/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:109845/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1129604/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1149524/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1163300/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1165991/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:119784/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1208952/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1235288/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1247320/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1256813/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1300694/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:13199/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1004405/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1371486/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:140487/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:142698/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1470173/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:1472221/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:148276/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:156940/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:200241/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:20157/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:203627/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:204033/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:229938/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:249932/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:272911/62‑1 (MQ=255) aTTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGAtg  <  1:315839/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATTAACAGATATCAAAGTCAGAGCAGCCAAGCCAACGGATAAGCAATATTAGCTGACTGATG  >  W3110S.gb/4501362‑4501423

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑