Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4545211	4545264	54	6 [0]	[0] 16	yjhA/fimB	N‑acetylnuraminic acid outer membrane channel protein/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA

AATGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGA  >  W3110S.gb/4545265‑4545326 |                                                              aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:1018321/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:1102515/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:1222967/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:129809/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:1429743/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:1444684/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:244024/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:294856/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:38357/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:392917/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:593883/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:824564/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:838850/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:918331/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:944824/1‑62 (MQ=255) aatGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGa  >  1:981077/1‑62 (MQ=255) |                                                              AATGTCATATGTGAGACGGCTAGTTGAACGAATATTAAATTTTGCTGAATTTTTTATGTTGA  >  W3110S.gb/4545265‑4545326

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑