Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4552074	4552085	12	38 [0]	[0] 50	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

ATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTT  >  W3110S.gb/4552086‑4552146 |                                                             aTTTAGATAACGCGTTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:137352/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGt                         >  1:728445/1‑38 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGa                  >  1:1068300/1‑45 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAg         >  1:1281503/1‑54 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:726694/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:274151/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:30192/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:355800/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:498343/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:559730/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:580962/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:597909/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:612656/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:700421/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:721899/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:218389/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:740516/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:795401/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:797026/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:81967/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:857524/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:857954/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:865059/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:955900/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:979022/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:997833/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1143937/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1035204/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:103595/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1037482/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1057793/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1068413/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:108736/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1088413/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1097420/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1098140/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1108526/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:255070/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1154216/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:12058/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1235394/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1235629/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1295441/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1314460/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1392448/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1395328/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1455497/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:209328/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGtt  >  1:1019983/1‑61 (MQ=255) aTTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGt   >  1:745638/1‑60 (MQ=255) |                                                             ATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTT  >  W3110S.gb/4552086‑4552146

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑