Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	61806	61844	39	4 [0]	[0] 41	hepA	RNA polymerase‑associated helicase protein

AAATACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAT  >  W3110S.gb/61845‑61905 |                                                             aaaTACGCTTCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:363636/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGccctt  <  1:1112250/61‑3 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:535109/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:317150/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:319338/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:327305/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:333408/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:342699/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:367224/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:501100/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:514879/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:516377/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:29921/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:588356/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:594355/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:595567/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:679901/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:721595/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:730717/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:783990/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:792900/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1335532/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:108354/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1087474/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1106982/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:111016/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1119732/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1120724/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1219231/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1255869/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1323597/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:314438/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:135035/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1419236/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1419938/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1433304/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1444620/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1470589/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:154269/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:1030798/61‑1 (MQ=255) aaaTACGCTCCGGGTAGAGCAAATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAt  <  1:142292/61‑1 (MQ=255) |                                                             AAATACGCTCCGGGTAGAGCATATCGCGAGCACGATCTTCCGCACTTTTACGTGCGCCCAT  >  W3110S.gb/61845‑61905

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑