Missing coverage evidence...
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TGTTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAGT  >  W3110S.gb/63268‑63329 |                                                              tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:636293/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1002902/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:282358/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:335883/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:336002/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:350995/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:35521/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:400590/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:450113/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:572306/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:631069/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:254607/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:643442/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:657817/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:660979/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:767356/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:791822/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:82011/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:897297/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:916473/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:959522/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1238432/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1056181/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1066222/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1162506/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1183370/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1187343/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:119905/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1222601/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1224464/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1235190/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:168987/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1284812/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1324264/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1339983/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1369244/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1402229/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1409735/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1413292/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:1441526/62‑1 (MQ=255) tgtTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:155982/62‑1 (MQ=255) tgtTCAGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAgt  <  1:649219/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGTTCGGCTCTATATCTTTAATTGCAGGCAATAACCACCCGCTACCGTGCTTATGAGGTAGT  >  W3110S.gb/63268‑63329

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑