Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4641761	4641800	40	19 [0]	[0] 42	creC	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon

GATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTGG  >  W3110S.gb/4641801‑4641862 |                                                              gATCCCGAAAGTTCTTTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:104825/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:79361/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:344239/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:378654/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:411509/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:509025/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:720535/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:737648/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:73975/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:785470/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:790901/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:32586/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:79794/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:835237/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:836496/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:847060/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:908250/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:94918/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:967505/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:976604/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:985335/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:987064/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:224672/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1083820/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:11135/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1185146/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1233412/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1241444/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1260086/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1264666/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1300389/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1345111/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1413361/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1425890/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1427611/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1440533/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1453599/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:185505/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:200134/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:215421/62‑1 (MQ=255) gATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:236471/62‑1 (MQ=255) gATACCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTgg  <  1:1061321/62‑1 (MQ=255) |                                                              GATCCCGAAAGTTCTGTGATGTATGTTGCCGCACCGATTATGGACGGCTCGCGGCTTATTGG  >  W3110S.gb/4641801‑4641862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑