Missing coverage evidence...
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TTCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTACC  >  W3110S.gb/152957‑153011 |                                                       ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTtctc                     >  1:912576/1‑36 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTcc                    >  1:302401/1‑37 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTc                     >  1:1258737/1‑36 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:582235/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:172107/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:253198/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:397995/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:403952/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:466406/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:511216/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:520040/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:522798/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:577701/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:159709/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:604796/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:628511/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:645029/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:743613/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:862109/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:8840/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:884292/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:8911/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:938747/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:990372/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1212018/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1006385/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1006673/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1029534/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1043322/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1052519/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1069013/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1076126/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1135750/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1162304/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:116247/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1004599/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1278979/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1335167/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1335208/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1365391/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1382450/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1404590/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:141955/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1451677/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGATTGTCCACCCTGTCCAACATTAcc  >  1:1367315/1‑55 (MQ=255) ttCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATCCTTGTc                     >  1:1229017/1‑36 (MQ=255) |                                                       TTCCCTGCTGCTCAATACCACGAACAAATGCTTGTCCACCCTGTCCAACATTACC  >  W3110S.gb/152957‑153011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑