Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	163498	163639	142	33 [2]	[0] 73	hrpB	predicted ATP‑dependent helicase

GGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACG  >  W3110S.gb/163640‑163692 |                                                     ggCAAACGGCATGGTAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:666842/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGGGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:966041/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAacg                    >  1:1402152/1‑35 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCAc   >  1:1378575/1‑52 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCAc   >  1:924324/1‑52 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCAc   >  1:893602/1‑52 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCAc   >  1:1354717/1‑52 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCAc   >  1:1254096/1‑52 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCAc   >  1:1272434/1‑52 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:581519/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:623730/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:610410/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:604471/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:588443/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:587639/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:582688/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:676540/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:580274/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:576555/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:571808/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:504833/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:480120/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:466150/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:429998/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:644466/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:666448/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:35100/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:691676/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:714079/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:734846/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:750596/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:768708/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:815650/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:851059/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:857343/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:904337/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:925993/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:948796/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:970261/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1150786/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:413861/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:13562/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1353991/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1324076/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1294288/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1267025/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1212444/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1161817/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:136035/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1104403/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1093981/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1067693/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1056624/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1050362/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1049364/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1043076/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:172209/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:409869/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1004697/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:339751/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:297462/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:270710/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:244749/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:235461/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:22570/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1362739/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1457634/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1446656/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1411602/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1409672/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1408919/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACg  >  1:1396852/1‑53 (MQ=255) ggCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCAGCCACg  >  1:833650/1‑53 (MQ=255) |                                                     GGCAAACGGCATGGGAGCGATGCTCGATGCCAACGACGCGCTAAGCCGCCACG  >  W3110S.gb/163640‑163692

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑