Missing coverage evidence...
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ATACATAAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTC  >  W3110S.gb/238773‑238834 |                                                              atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:635815/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:277261/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:308470/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:311034/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:351404/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:353881/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:362329/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:426113/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:456120/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:494276/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:578019/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:269574/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:681188/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:685408/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:726550/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:740640/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:750106/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:821843/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:834089/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:911394/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:941526/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1327833/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1011593/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1042075/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1085742/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:116941/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:118235/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1193459/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:120262/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1240049/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1281134/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:100756/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:133586/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1400775/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1405161/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1440405/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:1460214/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:14664/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:213672/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:223995/62‑1 (MQ=255) atacataAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTc  <  1:259523/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATACATAAATGGAGTCATGTTTTCCCTTTTCCATTTATCAAGTTCCTGTTGCCGTTTTAGTC  >  W3110S.gb/238773‑238834

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑