Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	258705	258779	75	8 [0]	[0] 21	phoE	outer membrane phosphoporin protein E

TTAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAC  >  W3110S.gb/258780‑258841 |                                                              ttAACGTTGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:336949/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCa                           >  1:1363602/1‑37 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:875573/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1079418/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:848626/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:72328/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:660722/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:581565/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:481401/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:402960/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:397255/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1621/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1398677/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1255606/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1226751/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1211522/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1148802/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1132790/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAc  >  1:1118699/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATAGATAAc  >  1:823452/1‑62 (MQ=255) ttAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGACATCGATAAc  >  1:711190/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTAACGTCGCGGTTTTCGTTTTTCCCTTGATATTGCAGGGTTAAGTTCAGGCCATCGATAAC  >  W3110S.gb/258780‑258841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑