Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	258842	258871	30	20 [0]	[0] 21	phoE	outer membrane phosphoporin protein E

CAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATT  >  W3110S.gb/258872‑258933 |                                                              cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAgg                 >  1:1188102/1‑47 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAgg                 >  1:1363245/1‑47 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCCCCAAAtt  >  1:1206198/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:954792/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:903930/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:87406/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:711997/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:63743/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:602147/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:358447/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:336226/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:187672/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:16119/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:1462206/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:1439221/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:120211/1‑62 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAt   >  1:245856/1‑61 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAt   >  1:398582/1‑61 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAt   >  1:158763/1‑61 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAt   >  1:887957/1‑61 (MQ=255) cAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAt   >  1:1073179/1‑61 (MQ=255) |                                                              CAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATT  >  W3110S.gb/258872‑258933

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑