Missing coverage evidence...
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GACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTGG  >  W3110S.gb/276010‑276071 |                                                              gACGGAGCTGGAAGCGCGAGTGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:956024/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:716859/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1024620/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:509783/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:511651/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:515117/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:528161/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:541238/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:549595/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:566390/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:604440/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:672997/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:706637/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:387521/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:738589/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:780347/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:788369/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:830091/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:843968/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:861907/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:873914/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:891012/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:998391/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1188543/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1027473/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1052891/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1070132/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1103196/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1123347/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1125338/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1128544/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1161888/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1177186/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:118477/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:38298/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1189256/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1229881/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1340012/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1381282/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1383014/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1416285/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1417288/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:165898/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:297196/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGCGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:1348180/62‑1 (MQ=255) gACGGAGCTGGAAGCGCCAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTgg  <  1:961045/62‑1 (MQ=255) |                                                              GACGGAGCTGGAAGCGCGAGGGTGTAACTTAGCCGACAGCCTGTGGTCAGCCAAAGTGCTGG  >  W3110S.gb/276010‑276071

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑