Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	325891	325968	78	26 [0]	[0] 98	betA	choline dehydrogenase, a flavoprotein

CGCCTGCACGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGTAG  >  W3110S.gb/325968‑326029  |                                                             tgCCTGTATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1448993/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATGATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:832338/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgt  <  1:355396/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:377710/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:478197/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:477490/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:474903/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:469693/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:465155/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:458918/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:450743/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:448859/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:427261/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:422792/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:402135/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:499664/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:377669/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:370482/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:365859/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:362896/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:360903/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:348093/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:339311/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:329849/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1001511/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:779621/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:982921/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:922761/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:902511/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:892498/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:86976/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:841875/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:834314/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:827480/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:791809/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:790691/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:788929/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:494560/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:776871/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:76955/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:768325/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:720004/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:698819/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:612053/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:610265/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:606721/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:605669/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:58053/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:312414/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1195894/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:31019/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1328/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1313643/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1304470/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1243831/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1236909/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:122990/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:121968/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1215483/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1207113/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1205368/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1358458/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1181899/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:112329/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1109139/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1086470/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1072436/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1048528/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1048483/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1043064/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1039133/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1031395/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1428282/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:255650/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:254950/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:252412/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:23089/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:227123/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:191683/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:158261/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1466154/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1361379/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1433073/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:256113/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:28949/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1425553/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1422428/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1409899/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:307154/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1371519/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1370192/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1366266/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:309058/61‑3 (MQ=255) tgCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTAAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:145931/61‑3 (MQ=255) tgCCCGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1293513/61‑3 (MQ=255)  gCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:1224325/61‑3 (MQ=255)  gCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:753126/61‑3 (MQ=255)  gCCTGCATGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGtgg  <  1:486308/61‑3 (MQ=255)  |                                                             CGCCTGCACGCCCGCTTCAATCATCGCTTCAAACAGCGGATTGACGCCGGGTTTGGAGGTAG  >  W3110S.gb/325968‑326029

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑