Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	405313	405428	116	46 [0]	[0] 54	yaiI	conserved hypothetical protein

CAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAATAT  >  W3110S.gb/405429‑405481 |                                                     cAACGTATTCGTGGCTAAATATAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1249322/53‑1 (MQ=39) cAACGTAGTCGTTGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1089058/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:509386/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:162889/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:171366/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:174068/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:18345/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:204974/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:236684/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:275400/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:344154/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:395074/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:401498/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:408768/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:470603/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:501029/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:147723/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:586928/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:659866/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:671766/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:676458/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:736340/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:766374/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:768072/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:781920/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:788002/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:845138/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:893092/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1280740/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1088763/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1100019/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1101052/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1106342/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1120758/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1127228/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1139435/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1143007/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1170871/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1228560/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:123888/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1280153/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1029916/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1295928/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1314417/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1318555/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1328913/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:132940/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1338540/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1390097/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1404556/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1406877/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1421850/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:1457178/53‑1 (MQ=255) cAACGTAGTCGTGGCGAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAatat  <  1:294215/53‑1 (MQ=255) |                                                     CAACGTAGTCGTGGCTAAATGTAATTTATTATTTACACTTCATTCTTGAATAT  >  W3110S.gb/405429‑405481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑