Missing coverage evidence...
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GTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCA  >  W3110S.gb/539088‑539149 |                                                              gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGGAGGTCa  <  1:1370088/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:260446/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:991384/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:986361/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:763049/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:739042/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:62762/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:495892/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:425887/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:409481/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:40405/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:29578/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:1033164/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:1431901/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:1389924/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:133589/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:1180790/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:1179022/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:1168882/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:1135634/62‑1 (MQ=255) gTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCa  <  1:104744/62‑1 (MQ=255) |                                                              GTTTGCCACGTCAGCAGCCCGGAAGGTGTTGAGGAAGTGACTCGTGCACGTCAGGAAGGTCA  >  W3110S.gb/539088‑539149

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑