Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	560742	560984	243	32 [0]	[0] 29	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

ATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCT  >  W3110S.gb/560985‑561046 |                                                              aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTATGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1001386/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAgcgcat  >  1:1231909/1‑60 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGcc   >  1:988191/1‑61 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGcc   >  1:149719/1‑61 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:3365/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:935761/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:882862/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:841386/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:808508/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:737988/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:697092/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:672094/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:637474/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:577273/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:562926/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:516629/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:369457/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:291007/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:287718/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1445203/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1421360/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1377618/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1292918/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1260982/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1245199/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1225440/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1177812/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCt  >  1:1106500/1‑62 (MQ=255) aTGAAAATGGCATAACGCTGAGACAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGcc   >  1:837197/1‑61 (MQ=255) |                                                              ATGAAAATGGCATAACGCTGAGCCAGCCTTTAGGGGATACCAATGTTTTGATTAAAGCGCCT  >  W3110S.gb/560985‑561046

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑