Missing coverage evidence...
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TTGTTTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTG  >  W3110S.gb/561695‑561756 |                                                              ttgttTTACGGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1228306/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAg                         >  1:928791/1‑39 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAAt                     >  1:452607/1‑43 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCa              >  1:851604/1‑50 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACg     >  1:476102/1‑59 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGc    >  1:1096100/1‑60 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:901854/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:666396/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:67966/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:730232/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:75801/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:78464/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:785752/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:547542/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:910729/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:922061/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:923926/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:932388/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:938444/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:944280/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:961792/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:979047/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:145565/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1166228/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1251753/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:130941/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1411036/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1445481/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1450150/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:616110/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1456483/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:17781/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:21198/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:214895/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:432083/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:432275/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:579693/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAACTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:436046/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGGGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1238748/1‑62 (MQ=255) ttgttTTACCGGAAAAATCCGGCTGGCTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTg  >  1:1334671/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTGTTTTACCGGAAAAATCCGGCTGGGTAGGTGTCTCAGCAATTTGTCCACCCGGTACGCTG  >  W3110S.gb/561695‑561756

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑