Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 617782 617815 34 19 [0] [0] 45 fepE regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains

GTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAGG  >  W3110S.gb/617816‑617876
|                                                            
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCa             >  1:1111045/1‑50 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:659457/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:313134/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:323416/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:329190/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:348309/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:418361/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:452176/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:56063/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:595154/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:614241/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:628041/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:63255/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:290508/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:684093/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:728950/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:737791/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:763556/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:777957/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:783202/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:804335/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:846358/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:849843/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1282688/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1082427/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1086481/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:10958/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1125781/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1141679/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1148642/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1208505/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1241137/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:125510/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:126213/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:310520/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1293756/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1371121/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1405173/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1410138/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1414947/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1442845/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:160510/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:16096/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:240886/1‑61 (MQ=255)
gTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAgg  >  1:1044862/1‑61 (MQ=255)
|                                                            
GTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATGGACCAATTAAAAGAGG  >  W3110S.gb/617816‑617876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: