Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	627330	627342	13	29 [0]	[1] 73	entB	isochorismatase

ACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCG  >  W3110S.gb/627342‑627403  |                                                             aCGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:305547/62‑1 (MQ=255)  cGTAACCTGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:155189/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATTTGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:284315/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:436527/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:518679/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:511932/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:49454/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:49290/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:490673/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:457041/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:446014/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:439962/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:532961/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:415536/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:410148/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:408201/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:402805/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:342629/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:302808/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:763113/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:990839/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:988608/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:945006/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:925853/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:882690/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:877586/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:863559/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:857909/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:77151/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:295465/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:748418/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:744608/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:716177/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:65989/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:649387/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:647640/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:64163/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:548434/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1159565/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1341291/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1330614/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:128754/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1270962/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1263275/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1256313/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1224651/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1197972/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1354563/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1142640/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1124923/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1097513/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1077436/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1061036/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1053137/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:103448/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1033971/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:186904/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1019462/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:290037/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:284355/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:264857/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:249817/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:242813/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:20655/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:187794/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:296880/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:174058/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:159151/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:148560/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1437602/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1422926/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1409757/61‑1 (MQ=255)  cGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCg  <  1:1365347/61‑1 (MQ=255)  |                                                             ACGTAACCAGCTGATTATTACCGGGGTATATGCCCACATTGGCTGTATGACCACCGCAACCG  >  W3110S.gb/627342‑627403

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑