Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	686709	687708	1000	30 [2]	[0] 49	[gltJ]–[gltI]	[gltJ],[gltI]

TTGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAC  >  W3110S.gb/687709‑687745 |                                     ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCa   >  1:916044/1‑36 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCa   >  1:489229/1‑36 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:723353/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:460131/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:481265/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:486924/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:508929/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:529113/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:540038/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:601361/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:608477/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:617931/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:700407/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:710794/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:454259/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:761990/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:764959/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:802112/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:836070/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:843660/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:857988/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:8988/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:936069/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:964535/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:999250/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:405550/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1053390/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1074609/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1121649/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1220629/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1223264/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1231532/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1237965/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1243991/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:126640/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1320833/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1328217/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1348886/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1451595/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:14618/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:159121/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:18655/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:255957/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:30177/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:352268/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:353013/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:39876/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1024559/1‑37 (MQ=255) ttGTCTTTAAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAc  >  1:1027999/1‑37 (MQ=255) |                                     TTGTCTTTCAGGTTGGCAAAATCTTTGATATCGCCAC  >  W3110S.gb/687709‑687745

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑