Missing coverage evidence...
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TGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGA  >  W3110S.gb/781469‑781512 |                                            tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:80603/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:463403/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:513989/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:601275/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:665713/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:683665/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:734316/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:747991/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:770427/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:431627/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:816081/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:837235/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:851108/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:921480/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:962825/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:968160/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:980525/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:177659/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:1216232/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:1345861/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:1375956/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:1424780/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:1426168/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:154197/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:159394/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:159991/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:210605/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:261922/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:26243/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:349246/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:383050/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:403005/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:41712/44‑1 (MQ=38) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCAGGTGATTAGCTCAGCTGGgaga  <  1:1076973/44‑1 (MQ=255) |                                            TGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGA  >  W3110S.gb/781469‑781512

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑