Missing coverage evidence...
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CAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAGGG  >  W3110S.gb/847579‑847640 |                                                              cAGGGTAATTAATGGCCCCTGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:516951/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCTCATAggg  <  1:1190160/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:92640/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:108849/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:893598/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:885962/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:825599/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:759911/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:672669/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:585668/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:526590/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:421580/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:419910/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:412522/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:402303/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:391531/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:366426/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:330881/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:323741/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:312607/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1471053/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1451680/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1445901/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1332413/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1324876/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1319643/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1216126/62‑1 (MQ=255) cAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAggg  <  1:1202108/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATAGGG  >  W3110S.gb/847579‑847640

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑