Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	969202	969336	135	45 [0]	[0] 48	lpxK	lipid A 4'kinase

CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTC  >  W3110S.gb/969337‑969387 |                                                   cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTc              >  1:438441/1‑39 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAAcggcgg      >  1:60455/1‑47 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgtgta  >  1:704152/1‑50 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgtgt   >  1:836597/1‑50 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgtgt   >  1:1345466/1‑50 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgt     >  1:58705/1‑48 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:625490/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:357973/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:39166/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:445902/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:446712/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:486514/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:51823/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:579052/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:595956/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:3355/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:67149/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:754316/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:801821/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:812673/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:873674/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:882180/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:888237/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:920870/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:935878/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:119831/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1030109/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1052683/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1086992/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:109518/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1099136/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1103367/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1112240/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1152113/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1156510/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1163497/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:116534/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1014697/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1209069/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1273715/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1306785/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1330983/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:133857/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:1364131/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:138668/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:138794/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:239474/1‑51 (MQ=255) cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTc  >  1:280558/1‑51 (MQ=255) |                                                   CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTC  >  W3110S.gb/969337‑969387

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑