Missing coverage evidence...
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AATTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACAGAG  >  W3110S.gb/1004436‑1004492 |                                                         aaTTTCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCTGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:826503/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCttt               >  1:205757/1‑44 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:653836/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:291289/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:339651/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:357990/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:396056/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:532848/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:572616/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:591360/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:61828/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:256091/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:828192/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:83423/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:860863/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:863065/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:881597/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:953465/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:979358/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1409344/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1140805/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1142974/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:119933/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1231985/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1236143/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1384339/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1388182/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:262743/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:141133/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1427216/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1429080/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1438993/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1445792/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:151824/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:168648/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACagag  >  1:1088483/1‑57 (MQ=255) aaTTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGAAGACagag  >  1:1309684/1‑57 (MQ=255) |                                                         AATTGCAGGCAGGAGTGGTGGTCGGCGGAACGCGATTTATCTTTCCGGCAGACAGAG  >  W3110S.gb/1004436‑1004492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑