Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1058637	1058727	91	12 [0]	[0] 38	torC	trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c‑type subunit

GCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGA  >  W3110S.gb/1058728‑1058789 |                                                              gCTGCATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:988075/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:511211/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:485713/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:544798/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:589236/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:611102/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:642234/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:666953/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:676197/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:683815/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:722744/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:735748/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:80183/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:818765/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:850583/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:879872/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:911928/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:925638/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:971617/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:212246/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:1033290/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:1054220/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:1070442/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:1139448/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:1222861/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:1233343/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:127830/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:146467/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:173013/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:1018809/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:274656/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:289421/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:296099/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:377662/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:387973/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:40848/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:449032/62‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGa  <  1:463117/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGA  >  W3110S.gb/1058728‑1058789

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑