Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1131530	1131653	124	26 [0]	[0] 24	flgM	anti‑sigma factor for FliA (sigma 28)

GCGGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTC  >  W3110S.gb/1131654‑1131714 |                                                             gcgGTTGAACGGTGCTTAGAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:541168/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCTATACTCATGGTTTATTc  >  1:112442/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATATTCATGGTTTATTc  >  1:54831/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTAtta  >  1:443803/1‑60 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:438596/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:978097/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:949052/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:907756/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:868662/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:623519/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:536458/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:489907/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:485154/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:100423/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:35590/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:309814/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:28779/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:227998/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:224046/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:165230/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:160190/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:1438068/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:1336779/1‑61 (MQ=255) gcgGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTc  >  1:1056168/1‑61 (MQ=255) |                                                             GCGGTTGAACGGTGCTTACAGGCTTCAGAGGCGAAGTGCGATCAATACTCATGGTTTATTC  >  W3110S.gb/1131654‑1131714

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑