Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1132766	1133105	340	34 [0]	[0] 15	[flgB]–[flgC]	[flgB],[flgC]

CTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGG  >  W3110S.gb/1133106‑1133165 |                                                            cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTTGTATTCCAgg  <  1:994608/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:1261455/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:1289567/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:1329548/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:1430139/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:227262/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:417779/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:594744/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:616607/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:670108/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:694622/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:743915/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:858262/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:942887/60‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGATCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAgg  <  1:807212/60‑1 (MQ=255) |                                                            CTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGG  >  W3110S.gb/1133106‑1133165

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑