Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1133166	1133280	115	15 [0]	[0] 34	flgC	flagellar component of cell‑proximal portion of basal‑body rod

CTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAC  >  W3110S.gb/1133281‑1133342 |                                                              cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:674768/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:395601/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:398331/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:415834/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:42016/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:422012/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:487716/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:614923/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:6440/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:353373/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:700512/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:706696/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:832260/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:863706/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:907107/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:970715/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:987095/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1404227/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1050820/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1091523/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1118211/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1261865/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1288677/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:13035/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1317976/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1357830/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:101117/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1414116/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1417102/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1456994/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:158396/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:175947/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:213618/62‑1 (MQ=255) cTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATATTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAc  <  1:1445468/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCATGTCGGCGTCAC  >  W3110S.gb/1133281‑1133342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑